Dans le dernier épisode, Haley revient à Tree Hill.
Saison 3. Dans le début de la saison 3, Haley est de retour à Tree Hill mais Nathan souhaite annuler leur mariage.
Dès la deuxième saison, Haley décide de partir en tournée avec Chris et ainsi mettre sa relation avec Nathan entre parenthèses. Une mauvaise passe pour le couple. Après avoir eu un petit garçon, Jamie, Haley et Nathan connaissent de nouvelles difficultés dans la cinquième saison.
Elle proposa à Nathan et sa femme Haley James ainsi qu'à l'agent de Nathan, Clayton Evans de dire au monde entier qu'elle avait menti en échange d'une grosse somme d'argent, mais les Scott ainsi que Clay refusèrent. Nathan assurant à tout le monde que jamais il ne tromperait Haley.
Or, Haley découvre qu'elle est enceinte dans l'épisode 5 de cette même saison. La jeune femme perd ensuite les eaux lors de la remise des diplômes.
Quand ils ont quitté la série, l'interprète de Lucas avait spécifié que des négociations financières n'avaient pas abouti comme il le voulait. De son côté, l'actrice qui joue le rôle de Peyton s'était confiée en 2020 dans le podcast Whine Down : "Je savais que j'avais besoin de commencer quelque chose de nouveau.
Résumé Lucas saute à l'eau pour aider Nathan à sortir Rachel et Cooper de leur voiture au fond de la rivière et les remonter à la surface.
Dans l'épisode 22, Brooke, a 7 mois de grossesse, tombe d'un tabouret et est emmenée en urgence à l'hôpital où elle donne naissance à des jumeaux Davis et Jude, qui sont placés en couveuse.
Dès le 1er épisode Brooke quitte Lucas en lui disant qu'elle a l'impression qu'elle ne lui manque pas, et que de ce fait il a cessé de lui manquer. Ils ne passent pas beaucoup de temps ensemble, elle lui en veut toujours et pense qu'il est avec Peyton.
Elle accouche au 18ème épisode de la saison de son second enfant, une petite fille, Lydia Bob Scott et fait de son fils Jamie un grand frère heureux et de son mari Nathan un père comblé, devenant papa d'une fille pour la première fois.
À la fin de la saison, lors du re-mariage de Haley et Nathan (en fait simple cérémonie, car lors de leur mariage, seuls les parents d'Haley étaient présents et ils veulent à présent faire une nouvelle cérémonie devant tous leurs amis), Dan apprend que la personne qui a tenté de le tuer n'est pas Keith mais Deborah, son ...
Haley découvre qu'elle est enceinte de son premier enfant et l'annonce à Nathan Scott dans l'épisode 5 de la saison 4, soit seulement un épisode avant que Nick dise à Brooke qu'il ne lui reste plus que trois mois d'école.
À la fin de la saison 7 des Frères Scott, Haley découvre qu'elle est enceinte de son deuxième enfant. Or, ce rebondissement dans l'intrigue s'explique par la grossesse de l'actrice Bethany Joy Lenz dans la vraie vie.
Brooke achète la boutique en face du Karen's Cafe. Julian a réussi à vendre sa série adaptée du livre de Lucas et achète la maison d'enfance de Brooke pour qu'ils s'y installent avec les enfants. De leur côté, Clay et Quinn décident d'adopter Logan, dont les anciens beaux-parents de Clay avaient jusqu'alors la garde.
Keith Scott est le fiancé de Karen Roe la mère de Lucas Scott. Il meurt tragiquement lorsque son frère Dan Scott le tue lorsqu'un élève rentre armé d'un pistolet dans le lycée.
L'état de Clay se dégrade et a besoin d'une transplantation rénale. Nathan décide de lui donner un rein, même si cela doit mettre un terme à sa carrière, mais il n'est pas compatible. Quinn est désespérée. Haley confie Jamie à Brooke et Julian pour pouvoir s'occuper de sa sœur.
Pour la neuvième saison, Lucas sera bien de retour mais Peyton devrait ne pas revenir dans la série. Qu'importe, mieux vaut le retour d'un acteur que l'absence des deux et les fans se réjouissent déjà en attendant de voir les nouveaux épisodes en janvier prochain.
Une nouvelle vie de famille pour Clay et Quinn
À l'issue du dernier épisode de la neuvième saison, Quinn et Clay décident de sauter le pas en se mariant. Par la suite, ils signent les papiers d'adoption de Logan, dont les anciens beaux-parents de ce dernier avaient jusqu'alors la garde.
Saison 8. Au début de la saison 8, Haley est enceinte de Lydia et se retrouve à gérer l'éducation de son fils, Jamie, qui pose de plus en plus de questions ainsi que sa carrière musicale car Nathan prépare son retour dans la NBA.
Il apprend aussi que son père avait mentit à propos de la raison de son arrêt du basketball, Nathan croyait que Dan s'était blessé, alors qu'en fait, il a quitté le basket volontairement. Ne supportant plus de devoir choisir entre son père et sa mère, Nathan se fait émanciper et va vivre dans son propre appartement.
Xavier Daniels est un criminel de Tree Hill qui a assassiné Quentin Fields, pris en otage Samantha Walker et son propre frère Jack Daniels, et agressé à deux reprises Brooke Davis.
Quentin est assassiné par l'agresseur de Brooke !
Après une tentative d'évasion ratée, Nathan se sent de plus en plus impuissant et perd espoir. Il est finalement sauvé par son père Dan avec l'aide de Julian et Chris Keller.
A Sète, Nathan a été retrouvé drogué et à moitié enterré dans le sable. Damien décide de faire un prélèvement.